Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fndc3c1Q6DFV6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fndc3c1Q6DFV6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fndc3c1Q6DFV6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fndc3c1Q6DFV6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fndc3c1Q6DFV6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms