Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep290Q6A078 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cep290Q6A078 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cep290Q6A078 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep290Q6A078 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep290Q6A078 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms