Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cep170Q6A065 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cep170Q6A065 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cep170Q6A065 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cep170Q6A065 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cep170Q6A065 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cep170Q6A065 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms