Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CilpQ66K08 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CilpQ66K08 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CilpQ66K08 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CilpQ66K08 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms