Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ctnna3Q65CL1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnna3Q65CL1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnna3Q65CL1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnna3Q65CL1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms