Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ccdc18Q640L5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
Ccdc18Q640L5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc18Q640L5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc18Q640L5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc18Q640L5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc18Q640L5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc18Q640L5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc18Q640L5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc18Q640L5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc18Q640L5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ccdc18Q640L5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc18Q640L5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc18Q640L5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc18Q640L5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc18Q640L5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc18Q640L5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc18Q640L5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc18Q640L5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ccdc18Q640L5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc18Q640L5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc18Q640L5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
Ccdc18Q640L5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
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