Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2kQ63871 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr2kQ63871 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2kQ63871 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms