Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga3Q62470 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga3Q62470 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga3Q62470 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms