Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcncQ62447 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CcncQ62447 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcncQ62447 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcncQ62447 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcncQ62447 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcncQ62447 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcncQ62447 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcncQ62447 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcncQ62447 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CcncQ62447 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcncQ62447 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CcncQ62447 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcncQ62447 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CcncQ62447 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcncQ62447 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CcncQ62447 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CcncQ62447 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CcncQ62447 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CcncQ62447 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms