Protein–RNA interactions for Protein: Q62433

Ndrg1, Protein NDRG1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg1Q62433 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndrg1Q62433 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ndrg1Q62433 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ndrg1Q62433 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndrg1Q62433 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndrg1Q62433 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndrg1Q62433 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndrg1Q62433 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndrg1Q62433 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndrg1Q62433 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndrg1Q62433 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndrg1Q62433 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndrg1Q62433 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ndrg1Q62433 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms