Protein–RNA interactions for Protein: Q62227

Nr0b2, Nuclear receptor subfamily 0 group B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr0b2Q62227 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr0b2Q62227 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr0b2Q62227 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr0b2Q62227 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr0b2Q62227 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr0b2Q62227 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr0b2Q62227 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr0b2Q62227 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nr0b2Q62227 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr0b2Q62227 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr0b2Q62227 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr0b2Q62227 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms