Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tgfb1i1Q62219 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tgfb1i1Q62219 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tgfb1i1Q62219 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tgfb1i1Q62219 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tgfb1i1Q62219 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgfb1i1Q62219 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgfb1i1Q62219 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgfb1i1Q62219 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgfb1i1Q62219 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tgfb1i1Q62219 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tgfb1i1Q62219 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tgfb1i1Q62219 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tgfb1i1Q62219 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms