Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Ttf1Q62187 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
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Ttf1Q62187 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ttf1Q62187 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Ttf1Q62187 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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Ttf1Q62187 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Ttf1Q62187 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ttf1Q62187 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
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Ttf1Q62187 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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Ttf1Q62187 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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Ttf1Q62187 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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Ttf1Q62187 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttf1Q62187 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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