Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssr4Q62186 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssr4Q62186 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssr4Q62186 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssr4Q62186 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssr4Q62186 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms