Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ddx3xQ62167 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx3xQ62167 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx3xQ62167 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx3xQ62167 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms