Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifi47Q61635 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ifi47Q61635 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifi47Q61635 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms