Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
AlcamQ61490 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
AlcamQ61490 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AlcamQ61490 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AlcamQ61490 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms