Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Msi1Q61474 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Msi1Q61474 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi1Q61474 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msi1Q61474 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms