Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PcolceQ61398 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcolceQ61398 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcolceQ61398 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PcolceQ61398 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PcolceQ61398 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PcolceQ61398 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PcolceQ61398 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PcolceQ61398 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcolceQ61398 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PcolceQ61398 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcolceQ61398 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcolceQ61398 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PcolceQ61398 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PcolceQ61398 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PcolceQ61398 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PcolceQ61398 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PcolceQ61398 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms