Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctnna2Q61301 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctnna2Q61301 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctnna2Q61301 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 340 ms