Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tsg101Q61187 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tsg101Q61187 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tsg101Q61187 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tsg101Q61187 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms