Protein–RNA interactions for Protein: Q61085

Rhpn1, Rhophilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhpn1Q61085 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhpn1Q61085 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhpn1Q61085 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhpn1Q61085 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhpn1Q61085 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhpn1Q61085 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhpn1Q61085 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhpn1Q61085 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rhpn1Q61085 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rhpn1Q61085 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms