Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DbpQ60925 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DbpQ60925 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DbpQ60925 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DbpQ60925 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DbpQ60925 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DbpQ60925 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DbpQ60925 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DbpQ60925 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DbpQ60925 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DbpQ60925 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DbpQ60925 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DbpQ60925 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DbpQ60925 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms