Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MarcoQ60754 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MarcoQ60754 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MarcoQ60754 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MarcoQ60754 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MarcoQ60754 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MarcoQ60754 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MarcoQ60754 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MarcoQ60754 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MarcoQ60754 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MarcoQ60754 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MarcoQ60754 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MarcoQ60754 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MarcoQ60754 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms