Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PtprnQ60673 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms