Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprnQ60673 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprnQ60673 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprnQ60673 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms