Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CttnQ60598 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CttnQ60598 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CttnQ60598 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CttnQ60598 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CttnQ60598 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CttnQ60598 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CttnQ60598 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CttnQ60598 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CttnQ60598 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CttnQ60598 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CttnQ60598 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CttnQ60598 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CttnQ60598 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CttnQ60598 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CttnQ60598 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CttnQ60598 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CttnQ60598 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CttnQ60598 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CttnQ60598 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CttnQ60598 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CttnQ60598 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms