Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Xrcc1Q60596 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc1Q60596 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc1Q60596 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms