Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A1cfQ5YD48 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A1cfQ5YD48 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A1cfQ5YD48 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A1cfQ5YD48 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms