Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rnf123Q5XPI3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rnf123Q5XPI3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rnf123Q5XPI3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rnf123Q5XPI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms