Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsr1Q5SWD9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsr1Q5SWD9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tsr1Q5SWD9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tsr1Q5SWD9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tsr1Q5SWD9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms