Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW28

Pik3r5, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r5Q5SW28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pik3r5Q5SW28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pik3r5Q5SW28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pik3r5Q5SW28 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3r5Q5SW28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3r5Q5SW28 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3r5Q5SW28 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pik3r5Q5SW28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3r5Q5SW28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3r5Q5SW28 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pik3r5Q5SW28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms