Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r196Q5SVD5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms