Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TefmQ5SSK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TefmQ5SSK3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TefmQ5SSK3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms