Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav3-3Q5R1C3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trav3-3Q5R1C3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav3-3Q5R1C3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms