Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CoblQ5NBX1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CoblQ5NBX1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CoblQ5NBX1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CoblQ5NBX1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CoblQ5NBX1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CoblQ5NBX1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms