Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Taf3Q5HZG4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf3Q5HZG4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf3Q5HZG4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf3Q5HZG4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Taf3Q5HZG4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf3Q5HZG4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf3Q5HZG4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Taf3Q5HZG4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf3Q5HZG4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf3Q5HZG4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf3Q5HZG4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf3Q5HZG4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms