Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chsy3Q5DTK1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Chsy3Q5DTK1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chsy3Q5DTK1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms