Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrig2Q52KR2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrig2Q52KR2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrig2Q52KR2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrig2Q52KR2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig2Q52KR2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig2Q52KR2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig2Q52KR2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrig2Q52KR2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig2Q52KR2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrig2Q52KR2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms