Protein–RNA interactions for Protein: Q497L3

Gm5800, Predicted gene 5800, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5800Q497L3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5800Q497L3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm5800Q497L3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm5800Q497L3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms