Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ankrd53Q3V0J4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd53Q3V0J4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd53Q3V0J4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd53Q3V0J4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd53Q3V0J4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd53Q3V0J4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd53Q3V0J4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd53Q3V0J4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms