Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc55Q3UY51 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc55Q3UY51 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc55Q3UY51 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc55Q3UY51 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms