Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc114Q3UX62 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc114Q3UX62 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc114Q3UX62 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc114Q3UX62 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc114Q3UX62 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms