Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clca4bQ3UW98 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Clca4bQ3UW98 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clca4bQ3UW98 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clca4bQ3UW98 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clca4bQ3UW98 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Clca4bQ3UW98 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clca4bQ3UW98 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clca4bQ3UW98 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms