Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm27235Q3UW50 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm27235Q3UW50 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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