Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVV9

Vwa3a, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3aQ3UVV9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa3aQ3UVV9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Vwa3aQ3UVV9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa3aQ3UVV9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Vwa3aQ3UVV9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3aQ3UVV9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3aQ3UVV9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3aQ3UVV9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3aQ3UVV9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vwa3aQ3UVV9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms