Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ2

Ubtfl1, Upstream-binding factor 1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtfl1Q3USZ2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ubtfl1Q3USZ2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubtfl1Q3USZ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubtfl1Q3USZ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms