Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN58

Faap20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faap20Q3UN58 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Faap20Q3UN58 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Faap20Q3UN58 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Faap20Q3UN58 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms