Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf3aQ3ULJ3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf3aQ3ULJ3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf3aQ3ULJ3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf3aQ3ULJ3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Upf3aQ3ULJ3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Upf3aQ3ULJ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Upf3aQ3ULJ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Upf3aQ3ULJ3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf3aQ3ULJ3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms