Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Usp19Q3UJD6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp19Q3UJD6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp19Q3UJD6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Usp19Q3UJD6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp19Q3UJD6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp19Q3UJD6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms