Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mcrip1Q3UGS4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mcrip1Q3UGS4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mcrip1Q3UGS4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms